เดิมทีพื้นที่บริเวณตำบลหนองอิรุณในปัจจุบัน มีหนองน้ำขนาดใหญ่อยู่ แห่งหนึ่งซึ่งชาวบ้านได้ใช้น้ำในหนองน้ำแห่งนี้บริโภค อุปโภคโดยเจ้าของที่ดินที่มี หนองน้ำนี้เป็นผู้หญิง ชื่อว่า "รุณ" ชาวบ้านละแวกนี้จึงเรียกหนองน้ำนี้ว่า "หนองอิรุณ" ต่อๆ กันมา และได้ใช้ชื่อหนองน้ำนี้เป็นชื่อตำบล และได้เปลี่ยนเป็น "หนองอิรุณ" เพื่อให้ไพเราะและได้ใช้ชื่อนี้เป็นชื่อตำบลในปัจจุบัน

           ประวัติความเป็นมา เดิมทีตำบลหนองอิรุณเป็นตำบลที่อยู่ในการปกครอง ของอำเภอพนัสนิคมประมาณปี 2479
           ต่อมาปี พ.ศ. 2481 กระทรวงมหาดไทย ได้มีพระราชกฤษฎีกายกฐานะ กิ่งอำเภอบ้านบึงเป็นอำเภอ ตำบลหนองอิรุณ จึงแยกจากอำเภอพนัสนิคม มาอยู่ในปกครองของอำเภอบ้านบึง
           และเมื่อปี พ.ศ. 2517 กระทรวงมหาดไทยได้มีการประกาศปรับปรุงเขตหมู่บ้าน และตำบลใหม่แยกบางหมู่บ้านของตำบลหนองอิรุณไปขึ้นอยู่กับกิ่งอำเภอหนองใหญ่ ได้แก่ บ้านหนองใหญ่, บ้านหนองเสือช้าง,บ้านคลองพลูปัจจุบันตำบลหนองอรุณ มีหมู่บ้านในตำบลจำนวน 12 หมู่บ้าน